在开发种植基地的同时，公司与战略合作者利益共享、风险共担，同时尝试将农产品向食品加工商品发展，像冠泉合作社原来主打富硒黄金梨，该梨品质非常好，细腻多汁，但是梨的个头很大，民众对分梨吃又很忌讳，在试售该产品时，市场反馈的销售结果并不十分满意，合作社社长受到来自种植户的极大压力，合作社社长求助公司一起谋求扩大富硒梨的销售，经过多方充分的论证，双方最后商定：将富硒梨做成梨汁，结合当地的阿胶特产，通过专业工厂生产富硒阿胶梨汁，富硒阿胶梨汁在市场试销，反响非常的好，相信正式推向市场后，这款商品必将成为销售市场又一畅销品种，合作社产品问题困局的成功化解，也增加了对富硒农产品加工商品的信心，相信未来会有越来越多的富硒加工商品上到富硒妈妈的货架上。
新型“订单农业”在产品供给上，得到数量保证和质量保证的富硒产品，同时随着战略合作基地的增多，所经营的富硒的产品门类和品种也越来越丰富，丰富的产品线使富硒妈妈越来越被关注健康的大众所接受和喜爱。但是问题也有一些，如筛选战略合作者方，需要到各行走访、需有当地信誉威望的人引荐，还需充分调查才能最终找到好的合作种植者，而这些公司大多需公司高层有阅历的领导亲自进行，这些工作占据主要领导的大量时间，未来合作中，如果发现不履行合作意向、或有欺瞒、或合作种植机构已经散伙的、或短视违反约定惜卖等不遵守合约的，导致合作不能继续履行，重新来过一次寻找新的该品种的合作伙伴，有时还会受到很多干扰，这些成本是高昂的。另一方面是远程监控操作上也带来巨大的工作量，拿到基地商品再进行富硒含量标准等质量检验外，派出农技专家到各地对战略合作基地进行巡查、稽核和技术指导，多地监控和实地观察种植实效品质，并加以分析，以确保未来订单能够有效完成，同时排查并敦促种植过程中按约定的技术和方式的进行，质量是企业的生命，如果商品种植生产过程中出现违规滥用、投机取巧等质量问题，那将对富硒妈妈品牌带来非常大的损失，这些工作繁杂而且花费精力和财力也很巨大。在物流方面，如叶菜类等保质期短的富硒蔬果叶很难运送到各地富硒妈妈专卖店，加之因种植基地分散，基本上是一品一个基地，一些丰富门类的单品，因销售数量少，物流不能选有专业可长期合作得物流商合作商，这些也加大了物流成本，推高了成本，因此在产品种植种类的宽度和完整度上也大大限制了基地的拓展速度。目前还只能实现基地生产什么就只能供给顾客什么，顾客自由挑选和选择富硒农产品的余地还很小，这让丰富顾客的餐桌需求处于相对瓶颈期，加之公司在互联网技术和网络会员开发等问题还没有得到最终满意的答案，这方面的工作推进速度慢，导致一个关键问题是，因成本高和市场接受度不高，导致富硒功能农产品销量还是小，并且增速也不理想，销量少就会失去和各方面合作者间的谈判砝码，也容易不被重视，这很大程度限制了基地的开拓，这些都是订单农业方面出现的一些问题，虽然困难很多，但在富硒农产品新型“订单农业”的路上还会坚定走下去。